本研究院与中国航天科技集团五院、八院，中国电子科技集团28所、54所，中国船舶重工集团701所、760所、716所、722所，中国兵器工业集团207所等；中国科学院空间中心，中国通用技术研究院等；军科网信所、陆军研究院等；清华大学、北京大学、国防科技大学、哈尔滨工业大学、华中科技大学、北京邮电大学、南京理工大学、大连大学以及南京信息技术研究院等科研院所和高校长期合作。团队与美国纽约州立大学、加州大学Davis分校、亚利桑那州立大学，英国斯特灵大学、英国肯特大学、Demont Ford 大学具有长期友好的学术合作和学生交流机制。