智能网络与信息系统研究院的历史可追溯到2005年获批的国家863空间信息安全基础技术重点实验室，2010年获批的教育部智能设计与先进计算重点实验室，2015年获批的国家工程实验室——智慧航运与物流网络技术。

智能网络与信息系统研究院立足国际科技前沿技术，面向国家重大需求、攻克智网核心技术、培育青年科技俊才。主要研究方向包括智能网络理论与技术、网络与通信安全、复杂系统信息与控制等。研究院科研人员已获得国家级科技进步二等奖2项，国防科技进步一等奖3项，省部级技术发明一等奖2项、科技进步一等奖2项，以及一批其他省部级奖励；研究院当前在研项目19项，其中国家级项目9项，年均科研经费2000余万元。

 研究院主体设于尚贤楼二层，总体科研办公面积1200余平米，建有由高性能网络测试仪、误码分析仪、逻辑分析仪、矢量信号发生器等构成的一体化智能网络演示验证平台，以及开展中大型网络体系架构和核心协议验证的全功能虚拟化网络仿真平台，可有力支持高水平科研的开展。